По завершении чемпионата России определились 22 клуба, которые напрямую попали в групповой этап Лиги чемпионов-2016/17. Ими стали "Барселона", "Реал", "Атлетико", "Севилья" (все – Испания), "Лестер", "Арсенал", "Тоттенхэм" (все – Англия), "Бавария", "Боруссия" Д, "Байер" (все – Германия), "Ювентус", "Наполи" (оба – Италия), "Бенфика", "Спортинг" (оба – Португалия), "Пари Сен-Жермен", "Лион" (оба – Франция), ЦСКА (Россия), "Динамо" (Украина), ПСВ (Голландия), "Брюгге" (Бельгия), "Базель" (Швейцария), "Бешикташ" (Турция). Еще 10 участников группового этапа определятся по итогам четырех квалификационных раундов.