15 января 2001 года старший тренер юношеской сборной Александр Кержаков дебютировал в основном составе «Зенита» в товарищеском матче против «Зимбру» (1:1) на межсезонных сборах.
Официальный дебют Кержакова за петербургский клуб состоялся 10 марта 2001 года в матче первого тура чемпионата России против «Ротора» (0:0). Форвард выступал за «Зенит» с 2001 по 2006 год и с 2010 по 2017 год. В составе «Зенита» Кержаков — трехкратный чемпион России, а также двукратный обладатель Кубка и Суперкубка России. За петербургский клуб он провел 386 матчей, в которых забил 162 гола и отдал 57 голевых передач.