333 матча провел в чемпионатах России "Рубин" под руководством Курбана Бердыева. Специалист дебютировал с казанской командой в премьер-лиге в сезоне-2003 и возглавлял ее до конца 2013 года. За это время "Рубин" одержал 148 побед, 97 раз сыграл вничью и в 88 случаях уступил.
8 раз "Рубин" Бердыева представлял Россию в еврокубках. Лучшим достижением в Лиге чемпионов стало третье место в группе (2009/10 и 2010/11). В Кубке УЕФА, превратившемся в Лигу Европы, – четвертьфинал сезона-2012/13. В Кубке Интертото – третий раунд в 2007 году.
5 трофеев выиграл "Рубин" за время работы в клубе Курбана Бердыева. Казанцы по два раза становились чемпионами (2008, 2009) и обладателями Суперкубка России (2010, 2012), а также завоевали Кубок страны (2012). Кроме того, Бердыев привел "Рубин" к победам в первом дивизионе (2002), Кубке Содружества (2010) и дважды финишировал третьим в чемпионате (2003, 2010).
2 футболиста, выступавших за "Рубин" весной 2017 года, становились чемпионами России под руководством Курбана Бердыева. Сергей Рыжиков и Гекдениз Карадениз пришли в клуб перед сезоном-2008 году и завоевали все главные трофеи команды. Также поиграть под руководством Бердыева успели Олег Кузьмин и Янн М'Вила. Голкипер Юрий Нестеренко регулярно попадал в запас, хотя ни одной встречи так и не провел.
1 сезон понадобился Бердыеву, чтобы привести клуб-дебютант к медалям чемпионата страны. Выиграв в 2002 году турнир первого дивизиона, казанцы год спустя отмечали первый в истории клуба бронзовый успех на высшем уровне. А через шесть лет праздновали и первое российское чемпионство.