РФС наложил на "Кубань" запрет регистрировать новичков из-за долгов перед Дмитрием Стажилой. Голкипер защищал цвета краснодарцев с февраля по декабрь 2016 года. Также клуб оштрафован за непогашенный долг перед Романом Концедаловым. Кроме того, РФС обязал "Кубань" произвести солидарную выплату "Уралу" за переход хавбека Сергея Ткачева из "Локомотива" в 2015 году.
"Кубань" по итогам сезона заняла седьмое место в таблице ФНЛ, отстав от зоны стыковых матчей на 4 очка.