1 июня 2016 года. Станислав Черчесов покинул варшавскую «Легию», с которой за год выиграл чемпионат и Кубок Польши.
11 августа 2016 года. Исполком РФС утвердил кандидатуру Черчесова на должность главного тренера сборной России. Спустя два часа после назначения тренер дал эксклюзивное интервью «СЭ» с заголовком «По приказу еще никто ничего не выигрывал».
31 августа 2016 года. Черчесов дебютировал в новой роли. В Анталье сборная России разошлась миром с турками — 0:0.
6 сентября 2016 года. Первый домашний матч и первая победа Черчесова. На стадионе «Локомотив» обыграна сборная Ганы — 1:0. Единственный мяч забил Федор Смолов, а капитан команды Василий Березуцкий провел 100-й матч за национальную команду.
17 июня 2017 года. Сборная России с победы стартовала на домашнем Кубке конфедераций. В Санкт-Петербурге благодаря автоголу Майкла Боксалла и голу Смолова обыграна Новая Зеландия. Далее последовали поражения от Португалии и Мексики и третье место в группе.
14 июня 2018 года. Российская команда, не знавшая побед в семи матчах подряд, разгромила Саудовскую Аравию в стартовом матче чемпионата мира — 5:0. Дубль оформил Денис Черышев, по голу забили Юрий Газинский, Артем Дзюба и Александр Головин.
19 июня 2018 года. Команда Станислава Черчесова уверенно победила Египет — 3:1 и вышла из группы на домашнем чемпионате мира. Это первое с 1986 года попадание в плей-офф для отечественной сборной.
1 июля 2018 года. Россия в «Лужниках» в серии пенальти победила Испанию (1:1, пен. — 4:3) и пробилась в четвертьфинал чемпионата мира. Черчесов и отразивший решающий пенальти Игорь Акинфеев стали одними из самых популярных людей в стране.
7 июля 2018 года. Сборная России в серии пенальти уступила будущему финалисту чемпионата сборной Хорватии (2:2, пен — 3:4). Сразу после турнира Черчесов попал в список претендентов на звание лучшего тренера года и продлил контракт со сборной.
14 октября 2019 года. Команда России разгромила киприотов (5:0) и за два тура до окончания отборочного турнира чемпионата Европы гарантировала себе попадание в финальную стадию. Позже выяснилось, что соперниками команды Станислава Черчесова станут команды Бельгии, Дании и Финляндии.
12 марта 2020 года Черчесов продлил контракт со сборной России до конца 2022 года. В случае успешного выступления на ЧМ-2022 соглашение будет действовать до лета 2024 года.
11 августа 2020 года. Станислав Черчесов стал первым тренером, которому удалось непрерывно работать со сборной России на протяжении четырех лет. Предыдущий рекордсмен Гус Хиддинк покинул команду после 3 лет и 356 дней работы.